Welche Enzyme erkennen Palindrome?
Restriktionsenzyme erkennen auf der doppelsträngigen DNA spezifische Bindungsstellen (recognition sequences). Viele dieser Erkennungssequenzen sind sog. „Palindrome“. Die Stellen an denen die DNA gespalten wird, werden als Spaltstellen (cleavage sites) bezeichnet.
Welche Rolle spielen Palindromische Sequenzen in der Molekularbiologie?
Eine Vielzahl dieser speziellen Makromoleküle erkennt eine bestimmte kurze, palindromische Sequenz innerhalb eines DNA-Abschnittes. Nach der Erkennung führen sie ihre jeweiligen Aktivitäten symmetrisch an beiden DNA-Strängen aus. Es hat seine Aufgabe in der epigenetischen DNA-Methylierung von CpG-Inseln.
Welches Enzym produziert Blunt Ends?
Restriktionsenzyme können die beiden komplementären Stränge glatt durchschneiden, so dass bei den Fragmenten stumpfe Enden (‚blunt ends‘) entstehen. Meist produzieren sie jedoch durch versetztes Schneiden überhängende Einzelstränge (‚sticky ends‘).
Was ist Crispr?
Daher auch der Zungenbrecher-Name CRISPR („Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats”), also “gehäuft auftretende, regelmäßig unterbrochene, kurze Palindrom-Wiederholungen“. Palindrom-Sequenz im Erbgut des Bakteriums Streptococcus agalactiae.
Wie entstehen blunt ends?
Je nach Schnittweise des Enzyms entstehen entweder sticky ends (klebrige Enden) oder blunt ends (stumpfe Enden). Bei sticky ends wird versetzt geschnitten, so dass überlappende Enden mit komplementären Basen entstehen. Blunt ends entstehen durch gerade Schnitte.
Warum entstehen sticky ends?
sticky ends, cohesive ends, klebrige Enden, kohäsive Enden, entstehen nach der Spaltung von DNA durch Restriktionsenzyme, welche die beiden Stränge der Doppelhelix an zueinander versetzten Stellen schneiden. Die Ligation von zueinander passenden sticky ends ist ca. 1000mal effektiver als die Ligation von blunt ends.